Get a site

متن کامل پایان نامه مقطع کارشناسی ارشد رشته :زیست شناسی

عنوان : طراحی و ساخت واکسن کاندید یونیورسال بر علیه ویروس های پاپیلوماانسانی سویه های ۶٫۱۱٫۱۶٫۱۸٫۳۱٫۴۵ بر پایه پروتئین های  L1 و L2

دانشگاه آزاد اسلامی

واحد علوم دارویی

دانشکده علوم و فناوریهای نوین

پایان نامه کارشناسی ارشد رشته میکروبیولوژی

 

 عنوان:

طراحی و ساخت واکسن کاندید یونیورسال بر علیه ویروس های پاپیلوماانسانی سویه های ۶٫۱۱٫۱۶٫۱۸٫۳۱٫۴۵ بر پایه پروتئین های  L1 و L2

                                                                              

استاد راهنما

دکتر مهدی مهدوی

 

استاد مشاور

دکتر مجید تبیانیان

سال تحصیلی ۱۳۹۳-۱۳۹۲

(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)

تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :

(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)

فهرست مطالب

عنوان                                                                 صفحه

فصل اول: مقدمه ..۱

مقدمه: ۲

فصل دوم: کلیات و مروری بر مطالعات گذشته….۸

۲-۱- تاریخچه. ۹

۲-۲- طبقه بندی.. ۱۵

۲-۳- ساختمان ویریون. ۱۶

۲-۴- ساختمان و سازماندهی ژنوم. ۱۶

۲-۵- تکثیر ویروس… ۱۸

۲-۵-۱- اتصال ورود ، پوشش برداری.. ۱۹

۲-۵-۲- پروموترهای ویروسی و تنظیم نسخه برداری.. ۱۹

۲-۵-۳ – سرهم بندی و رها شدن ویروس… ۲۱

۲-۵-۴- همانند سازی DNA ویروس… ۲۱

۲-۶- الحاق DNA ویروسی در ژنوم انسان. ۲۳

۲-۷- پروتئین های ویروسی.. ۲۴

۲-۷-۱- پروتئین های اولیه E1 تا E6.. 24

۲-۷-۲- پروتئین E7.. 25

۲-۷-۳- پروتئین های L1 و L2.. 28

۲-۸- تیپ بندی پاپیلوماویروس ها ۲۹

۲-۹- بیماری زایی.. ۲۹

۲-۹-۱- عفونت پوستی.. ۳۰

۲-۹-۲- عفونت حفره دهانی.. ۳۱

۲-۹-۳- عفونت مجاری تنفسی.. ۳۱

۲-۹-۴- سرطان مقعد. ۳۱

۲-۹-۵- سرطان گردن رحم. ۳۲

۲-۹-۶- HPV در کودکان. ۳۴

۲-۱۰- اپیدمیولوژی.. ۳۵

۲-۱۱- مطالعه سرطان گردن رحم و عفونت پاپیلوماویروس در ایران. ۳۷

۲-۱۲- تشخیص…. ۳۸

۲-۱۳- پاسخ ایمنی در برابر HPV.. 40

۲-۱۳-۱- ایمنی اختصاصی.. ۴۱

۲-۱۳-۱- ۱- پاسخ ایمنی هومورال. ۴۱

۲-۱۳-۱-۲- پاسخ ایمنی سلولی.. ۴۲

۲-۱۳-۲-پاسخ ایمنی ذاتی.. ۴۳

۲-۱۴-  درمان. ۴۴

۲-۱۵- پیشگیری.. ۴۵

۲-۱۶- واکسیناسیون. ۴۶

۲-۱۷- واکسیناسیون علیه HPV.. 47

۲-۱۷-۱- واکسن های نوترکیب با ناقل زنده ۵۰

۲-۱۷-۲-واکسن های پروتئینی و پپتیدی.. ۵۱

۲-۱۷-۳-ذرات شبه ویروس( VLPs). 52

۲-۱۷-۴-  DNA واکسن ها ۵۶

-۵-۱۷-۲ واکسن های خوراکی.. ۵۹

۲-۱۸- اهمیت پاسخ های ایمنی هومورال و واکسن های پیشگیری کننده ۶۳

۲-۱۹- اهمیت پاسخ های ایمنی سلولی و واکسن های درمان کننده ۶۴

۲-۲۰-ایمونوانفورماتیک در علم واکسن.. ۶۵

۲-۲۰-۱-ﭘﺎﯾﮕﺎه های داده ها (Databases) 68

۲-۲۰-۱-۱- پایگاه های داده اﯾﻤﻮﻧﻮﻣﯿﮏ… ۶۸

۲-۲۰-۱-۲- ﭘﺎﯾﮕﺎه داده اپی توپ ها و ﺳﺎﺧﺘﺎرهای آﻧﺘﯽ ﺑﺎدی ﺑﺮای ﺳﻠﻮل B.. 69

۲-۲۰-۱-۳- ﭘﺎﯾﮕﺎه داده اﭘﯽ ﺗﻮپ ﺳﻠﻮلT.. 72

۲-۲۰-۲-اﺑﺰارها و اﻟﮕﻮرﯾﺘﻢ های ﻣﺘﻨﻮع ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ.. ۷۳

۲-۲۰-۲-۱-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮل B.. 74

۲-۲۰-۲-۲-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮل B ﺑﺮ ﻣﺒﻨﺎی ﻣﯿﻞ ذاﺗﯽ آﻣﯿﻨﻮاﺳﯿﺪ. ۷۵

۲-۲۰-۲-۳-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اﭘﯽ ﺗﻮپ ﺳﻠﻮلB ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از روش های ﯾﺎدﮔﯿﺮی ﻣﺎﺷﯿﻦ.. ۷۷

۲-۲۰-۲-۴-روش ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﻏﯿﺮ پیوسته ﺳﻠﻮل B.. 78

۲-۲۰-۲-۵-ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ های ﺳﻠﻮل T.. 82

۲-۲۰-۳- ﮐﺎرﺑﺮدهای ﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اﭘﯽ ﺗﻮپ.. ۸۳

۲-۲۱-واکسن همگانی (Universal vaccine) 84

۲-۲۲- واکسن سازی معکوس Reverse Vaccinology.. 84

۲-۲۳-ادجوانت ها ۸۶

۲-۲۴-به دست آوردن قطعه DNA یاژن مورد نظر. ۸۹

۲-۲۵-کلونینگ ژن. ۹۰

۲-۲۵-۱- مراحل کلون کردن ژن. ۹۰

۲-۲۵-۲- میزبان کلونینگ… ۹۰

۲-۲۶- آنزیم های محدود کننده ۹۱

۲-۲۶-۱-آنزیم لیگاز. ۹۱

۲-۲۷- حامل های کلونینگ… ۹۱

۲-۲۸-غربالگری وجود ژن. ۹۲

۲-۲۹-انواع سیستم های بیانی و مزیت اشرشیاکلی.. ۹۲

۲-۳۰-وکتورهای بیان کننده ۹۴

۲-۳۰-۱- وکتورهای بیان کننده سیستمpET.. 94

۲-۳۱-وکتورهای پلاسمیدی.. ۹۶

۲-۳۲-توالی شاین دلگارنو(SD)(Shine-delgarno) 97

۲-۳۳-استراتژی بیان در سیستمpET.. 97

۲-۳۴-نقشه و مشخصات وکتورpET28a(+) 98

۲-۳۵-تولید پروتئین نوترکیب.. ۹۹

۲-۳۶-مراحل تهیه یک پروتئین نوترکیب در اشرشیاکلی.. ۹۹

۲-۳۷-بیان ژن و تولید پروتئین نوترکیب در E.coli. 100

۲-۳۸-راهکارهای افزایش تولید پروتئین نوترکیب در اشرشیاکلی.. ۱۰۱

۲-۳۹-تخلیص پروتئین نوترکیب.. ۱۰۲

۲-۴۰- فرضیات و هدف از انجام تحقیق.. ۱۰۳

۲-۴۰-۱ -فرضیات.. ۱۰۳

۲-۴۰-۲ – هدف از انجام تحقیق.. ۱۰۳

 

فصل سوم: مواد و روش ها…۱۰۴

۳-۱-مجموعه توالی های پروتئین.. ۱۰۵

۳-۲-پیش بینی اپی توپ سلول B.. 105

۳-۳-قابلیت دسترسی اپی توپ به حلال. ۱۰۶

۳-۴-محل های N-Glycosylated.. 107

۳-۵-ترجمۀ معکوس اولین ساختمان. ۱۰۷

۳-۶-بهینه سازی کدون، تعیین کدون های نادر (rare codon) 108

۳-۷-تولید ساختار واکسن.. ۱۰۹

۳-۸-تهیه باکتری مستعد شده ۱۰۹

۳-۹-ترانسفورم نمودن پلاسمید بیانی.. ۱۱۱

۳-۱۰- SDS-PAGE. 114

۳-۱۱-بیان پروتئین نوترکیب HPV   واکسن کاندید چند اپی توپی در مقیاس کم. ۱۱۵

۳-۱۲-کشت انبوه سویه بیانی و تهیه جسم سلولی.. ۱۱۷

۳-۱۳-بیان پروتئین نوترکیب HPV  واکسن کاندید چند اپی توپی در مقیاس بالا. ۱۱۷

۳-۱۴-الکتروفورز پروتئین در ژل آکریل آمید در حضور SDS. 119

۳-۱۵- رنگ آمیزی ژل با کوماسی بلوR-350.. 122

۳-۱۵-۱- روش تهیه محلول ها ۱۲۲

۳-۱۵-۲- روش رنگ آمیزی.. ۱۲۳

۳-۱۶- وسترن بلاتینگ… ۱۲۳

۳-۱۶-۱- انتقال در تانک… ۱۲۴

۳-۱۶-۲- مسدودسازی غشا ۱۲۵

۳-۱۶-۳- تشخیص با آنتی بادی.. ۱۲۵

۳-۱۷-تخلیص پروتئین با یون های نیکل متصل به ماتریکس NTA نوترکیب HPV   واکسن کاندید چند اپی توپی روی ماتریکس Ni-NTA.. 126

۳-۱۸-بهینه سازی تخلیص…. ۱۲۷

۳-۱۹-ارزیابی پروتئین تخلیص شده با روش SDS-PAGE. 127

۳-۲۰-تخلیص انبوه پروتئین نوترکیبHPV  واکسن کاندید چند اپی توپی.. ۱۲۸

۳-۲۱- دیالیز و تغلیظ پروتئین HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده ۱۳۴

۳-۲۲- ارزیابی پروتئین تخلیص شده ۱۳۶

۳-۲۳- روش برادفورد. ۱۳۶

۳-۲۳-۱- طرز تهیه محلول های مورد نیاز. ۱۳۷

۳-۲۳-۲- طرز تهیه محلول برادفورد. ۱۳۷

۳-۲۳-۳- طرز تهیه محلول استاندارد پروتئین ذخیره با غلظت ۱۰۰۰μic/ml. 137

۳-۲۳-۴- طرز تهیه محلول استاندارد پروتئین با غلظت ۱۰,۱۰۰mic/ml 137

۳-۲۴- بررسی خلوص پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده با روش SDS-PAGE. 138

۳-۲۵-بررسی پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی تخلیص شده با وسترن بلات.. ۱۳۸

۳-۲۶-پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی.. ۱۳۹

۳-۲۷- حیوان آزمایشگاهی.. ۱۳۹

۳-۲۸-ادجوانت‌ فروند ناقص…. ۱۳۹

۳-۲۹-گروه‌های تجربی و واکسیناسیون موش‌ها ۱۴۰

۳-۳۰- بررسی پاسخ های همورال. ۱۴۱

۳-۳۰-۱- بررسی سطح آنتی بادی توتال در رقت های مختلف سرمی.. ۱۴۲

 

فصل چهارم: نتایج ….۱۴۴

۴-۱-پیش بینی اپی توپ سلول B.. 145

۴-۲- قابلیت دسترسی اپی توپ ها ۱۴۹

۴-۳-محل های N-Glycosylated.. 151

۴-۴-انتخاب اپی توپ ها و اتصال پپتیدها برای تولید ساختمان واکسن.. ۱۵۳

۴-۵-ارزشیابی توالی پروتئین.. ۱۵۵

۴-۶-ترجمۀ معکوس ساختمان اول. ۱۵۷

۴-۷-نتایج تایید بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی با روش      SDS-PAGE.. 159

۴-۸- نتایج تایید بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی با روش وسترن بلاتینگ… ۱۶۱

۴-۹-نتایج بررسی پاسخ های ایمنی همورال. ۱۶۲

۴-۹-۱- نتایج بررسی سطح آنتی‌بادی توتال اختصاصی واکسن کاندید. ۱۶۲

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری………۱۶۴

۵-۱- بحث و نتیجه گیری.. ۱۶۵

۵-۲-پیشنهادات و چشم اندازها ۱۶۸

 References      …۱۶۹

ضمائم:

فهرست اشکال :

شکل ۲-۱٫ساختمان ویروس پاپیلوما……………………………………………………………………………………………………………………….۱۶

شکل ۲-۲٫ نقشه ژنومی در پاپیلوما ویروس……………………………………………………………………………………………………………..۱۸

شکل۲-۳٫نمایی از تکثیر پاپیلوما ویروس در ارتباط با عملکرد پروتئین های غیرساختاری……………………………………………..۱۸

شکل۲-۴٫ مواردی از عفونت پاپیلوما ویروس ها……………………………………………………………………………………………………..۳۰

شکل ۲-۵٫ مراحل اصلی پاپیلوماویروس و محل آنها در اپی تلیوم اسکوآموس…………………………………………………………….۴۱

شکل ۲-۶٫ ساختار شماتیک و توالی ژنی ناحیه بیانی pET-28a(+)…………………………………………………………………………..99

شکل۴-۱٫ نمایش انتخاب اپی توپ ها با میزان بالای قابلیت دسترسی به حلال ، در اینجا ساختمان های پروتئین L1 از سروتایپ های HPV 11, 16, 18, 31, 45 نشان داده شده اند…………………………………………………………………………………۱۵۱

شکل۴-۲٫طراحی اولیه ساختار اپی توپ های منتخب ، E1 تا E10 برای پروتئین L1 و  E11 تا E20  برای L2 طراحی شدند………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۱۵۵

شکل ۴-۳٫ آنالیز آنتی ژنی سیتی ساختمان توسط برنامه پروتئان آنالیز ،. این نتایج نشان داد که قسمت های اصلی ساختار پروتئنی جدید خصوصیات هیدروفیلیک دارد، بنابراین توان آنتی ژنیک را دارد……………………………………………………………۱۵۷

شکل۴-۴٫ توالی ترجمه شده معکوس برای بهینه سازی کدون و کدون نادر برای افزایش سطح بیان ژن و انحلال پذیری پروتئین  ارزشیابی شد. به این منظور OPTIMIZER و سرورهای GenScript با هم بکار برده شدند…………………..۱۵۸

ششکل ۴-۵٫ نتایج ترجمه معکوس و بهینه سازی …………………………………………………………………………………………………۱۵۹

شکل ۴-۶٫نتایج تایید بیان پروتئین نوترکیب HPV واکسن کاندید چند اپی توپی و مشاهده باند در محدوده ۴۵ کیلو دالتون……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۱۶۰

شکل۴-۷٫ pET28a(+)/HPV، SDS-PAGE قبل و بعد از تخلیص پروتئین ، نتیجه تخلیص به صورت تک باند و در محدوده ۴۵KD است………………………………………………………………………………………………………………………………………….۱۶۰

شکل۴-۸٫ نتایج Western Blot و SDS-PAGE ، نتیجه در محدوده ۴۵KD است……………………………………………..۱۶۱

شکل۴-۹٫ SDS-PAGE بعد از تخلیص انبوه پروتئین ، نتیجه به صورت تک باند و در محدوده ۴۵KD است…………..۱۶۲

فهرست جداول:

جدول ۲-۱٫ خصویات واکسن چهار ظرفیتی و دوظرفیتی HPV ……………………………………………………………………………….53

جدول ۲-۲٫واکسن های پیشگیری کننده در حال توسعه……………………………………………………………………………………………۶۱

جدول۲-۳٫واکسن های درمانی HPV درحال توسعه………………………………………………………………………………………………..۶۲

ﺟﺪول۲-۴٫ﭘﺎﯾﮕﺎه داده اپی توپ ها و ﺳﺎﺧﺘﺎرهای آﻧﺘﯽ ﺑﺎدی ﺑﺮای ﺳﻠﻮل B ﻣﺨﺘﻠﻒ ……………………………………………………..۷۲

ﺟﺪول ۲-۵٫ ﺗﻌﺪادی از اﺑﺰارهای ﻣﻮﺟﻮد جهتﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮل B ………………………………………………………….75

ﺟﺪول ۲- ۶ . ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻣﻮﺟﻮد جهتﭘﯿﺸﮕﻮﯾﯽ اپی توپ هایﺳﻠﻮلB  ……………………………………………………………………………۸۰

جدول۳-۱٫ سکانس های استفاده شده برای طراحی ساختار کاندید یونیورسال واکسن HPV……………………………………..105

جدول۳-۲٫گروه بندی موش های مورد مطالعه………………………………………………………………………………………………………۱۴۱

جدول ۴-۱٫ پیش بینی اپی توپ سروتیپ های HPV 11.16.18, 31, 45 با بهره گرفتن از سرور BCPREDS……………….149

جدول ۴-۲٫فهرست نتایج مدل سازی همولوژی برای پروتئین های L1 از HPV نوع های ۱۱، ۱۶، ۱۸، ۳۱ و ۴۵٫٫٫٫٫٫٫٫٫٫٫۱۵۰

جدول۴-۳٫ امتیاز و محدوده آسپاراژین در توالی اپی توپ ها را نشان  می دهد…………………………………………………………۱۵۳

جدول۴-۴٫ ۲۰  اپی توپ مناسب انتخاب شده از پروتئین های L1 و L2  ………………………………………………………………۱۵۴

جدول ۴-۵٫ نتایج طراحی پروتئین و محاسبه پارامترهای مربوطه……………………………………………………………………………..۱۵۶

فهرست نمودار ها :

نمودار ۴-۱٫ نتایج بررسی سطح آنتی بادی توتال در گروه های تجربی…………………………………………………………………….۱۶۳

خلاصه

سرطان گردن رحم بعد از سرطان سینه دومین سرطان شایع زنان در سراسر جهان می باشد. بیش از ۹۰% سرطان های گردن رحم ، واجد پاپیلوما ویروس های انسانی  (HPV)هستند. بیش از ۱۰۰ نوع مختلف پاپیلوما ویروس انسانی وجود دارد که بیش از ۴۰ گونه ژنوتیپی  این ویروس ها، عفونت زا هستند و از آن میان حدود ۱۵ ژنوتیپ، کارسینوژن هستند که تحت عنوان ژنوتیپ های high-risk نام برده        می شوند و ژنوتیپ ۱۸ و  ۱۶ در بین آنها عامل بیش از ۹۰ % سرطان های مرتبط با این ویروس هستند.  پروتئین کپسید L1 پاپیلوما ویروس ها زمانی که در سیستم های بیان کننده پروتئین های یوکاریوتی و پروکاریوتی بیان می شوند ذرات ویروسی مانند  غیر عفونی را تشکیل می دهند که باعث القاء پاسخ آنتی بادی خنثی کننده ضد HPVs می شوند. این پروتئین اکنون نیز به عنوان واکسن استفاده         می شود و احتمالا وجود پروتئین۲ L در واکسن میتواند از طیف گسترده تری از تیپ های ویروسی پیشگیری کند، هرچند که              اپی توپ های خنثی کننده آن شبیه به L1 توانایی حفاظت کنندگی را ندارند اما اپی توپ های آن واکنش های متقاطع را به خوبی القا     می نمایند. در حال حاضر واکسن هایی که برای ویروس HPV وجود دارد، نمی تواند تمام سروتیپ های پر خطر آن را پوشش دهد و از لحاظ قیمت نیز پر هزینه است.

در تحقیق حاضر طراحی یک واکسن یونیورسال چند اپی توپی برای پروتئین های ساختمانی اصلی ویروس های HPV که شامل  L1/L2 است با بهره گرفتن از استراتژی های  ایمونو انفورماتیک در بررسی ۶ نوع پرخطر ویروس HPV سویه های ۶،۱۱،۱۶،۱۸،۳۱،۴۵، تلاش در طراحی و ساخت واکسنی شده است که این سروتیپ ها را پوشش دهد ، در این خصوص اقدام به شناسایی بهترین اپی توپ های برانگیخته کننده لنفوسیت هایB ، برای پیشگیری از وقوع  بیماری های مرتبط در جهت مطالعه به عنوان کاندید یونیورسال واکسن شد به این ترتیب با در نظر گرفتن بیشترین سطح تحریک شوندگی لنفوسیت های B- اپی توپ های پروتئین های کپسیدی L1 وL2، از نظر قابل دسترس ترین  اپی توپ ها با توجه به طراحی سه بعدی آن ها، در نظر گرفتن نواحی N گلیکوزیله شده، هیدروفیلیسیته و آنتی ژنسیته، بهترین اپی توپ ها شامل بیست اپی توپ بیست  اسید آمینه ای انتخاب و پس از آنالیزهای مثبت، ساختار نهایی مشتمل بر چهارصد اسید آمینه به صورت DNA طراحی  شد و به صورت ۱۲۰۰ نوکلئوتید ترجمه معکوس گردید، سپس در جهت بهترین بیان در E.coli بهینه سازی شد. آنزیم های برش گر BamHI و HindIII به ابتدا و انتهای توالی اضافه و سپس در غالب یک ساختار ژنی در کنار یکدیگر قرار داده شد. ژن طراحی شده مذکور ، توسط شرکت بیوماتیک سنتز شده و در پلاسمید pET28a کلون گردید. پس از دریافت پلاسمید مذکور، در سلول های E.coli BL21DE3 ترانسفرم گردید. بیان پلاسمید نوترکیب در سلول های باکتری با اضافه نمودن ۱میلی مولار IPTG در طول ۴ ساعت کشت انجام شد و سپس پروتئین توسط ستون کروماتوگرافی   Ni-NTA خالص شد و خلوص با تکنیک SDS-page تائید شد و سپس در برابر آنتی بادی anti-His در وسترن بلات مورد تایید قرار گرفت. جهت بررسی ایمنی زایی، واکسن کاندید همراه با ادجوانت فروند ناقص همراه با گروه کنترل  PBS به گروه های موشی  BALB/c (n=6 ) دو بار و به فاصله ۲ هفته بصورت زیر پوستی تزریق شدند که میزان تزریق در هر سری ۱۰ میکروگرم بود. یک هفته پس از دومین واکسیناسیون موش ها ،توتال آنتی بادی ها به روش الایزای غیر مستقیم ارزیابی شدند. نتایج نشان داد که واکسن کاندید تولید شده در میزبان باکتریایی و خالص شده به وسیله ی Ni-NTA، یک باند در حدود ۴۵ کیلو دالتون در وسترن بلات نشان داد. همچنین واکسیناسیون با واکسن کاندید یونیورسال بر پایه ی L1/L2 HPVs  منجر به افزایش قابل توجه در پاسخ ایمنی همورال در مقایسه با گروه کنترل شد.

واژه های کلیدی : پاپیلوما ویروس انسانی، پروتئین کپسید L1 و L2 ، چند اپی توپی، یونیورسال واکسن

فصل اول

مقدمه

پاپیلوما ویروس ها، گروهی از ویروس های DNA دار هستند که باعث ایجاد زگیل  یا پاپیلوم در انواعی از مهره داران عالی از جمله انسان ها می شوند. همچنین بعضی از پاپیلوما ویروس ها می توانند در حیوانات و انسان ها بدخیمی ایجاد کنند. تعدادی از پاپیلوما ویروس ها به عنوان عوامل ایجاد کننده سرطان گردن رحم و سایر تومورهای اپی تلیال مطرح شده اند (۱). این ویروس ها، ذراتی کروی، کوچک و بدون پوشش با اندازه ای حدود ۵۵ نانومتر هستند که کپسید آنها تقارن بیست وجهی دارد و ژنوم DNA دو رشته ای خطی این ویروس را در بر می گیرد (۶،۵،۴،۳،۲). این ویروس ها کاملا اختصاصی گونه و بافت می باشند و در سلول های اپی تلیال پوست و مخاط تکثیر می شوند و برای ایجاد عفونت پایا باید سلول های بازال را آلوده کنند (۴،۱).

علیرغم تنوعی که در پاپیلوماویروس ها وجود دارد، تشابه بسیار زیادی در سکانس پروتئینی و نوکلئوتیدی اعضای خانواده پاپیلوماویروس وجود دارد و ژنوم های مجزا، سازماندهی ژنتیکی مشابهی دارند (۷). ژنوم این ویروس ها از ۳ ناحیه مجزا تشکیل شده است که شامل ناحیه کنترلی غیر کد کننده ، ناحیه اولیه و ناحیه تاًخیری می باشد. ناحیه کنترلی حاوی توالی های تنظیمی است. ناحیه اولیه شش پروتئین            غیر ساختمانی اولیه E1, E2 E4, ,E5, ,E6 ,E7 و ناحیه تاخیری، دو پروتئین کپسیدی L1 و L2 را          کد دهی  می کند (۹،۸،۱). کپسید ویروس از دو پروتئین ساختمانی تشکیل شده است. پروتئین کپسید اصلی یا L1 دارای وزن مولکولی حدودا ۵۵ کیلو دالتون است که تقریبا ۸۰ درصد کل پروتئین های ویروس را شامل می شود (۱۰). پروتئین کوچک یا L2 تقریبا ۷۰ کیلو دالتون است و در کپسید ویروس جای دارد. ذرات شبه ویروسی یا VLP از پاپیلوما ویروس های مختلف به وسیله بیان ژن L1 به تنهایی یا همراه پروتئین L2 در سیستم های بیان کننده PESTAN(به خاطر محدودیت سایت در درج بعضی کلمات ، این کلمه به صورت فینگیلیش درج شده ولی در فایل اصلی پایان نامه کلمه به صورت فارسی نوشته شده است)داران و غیرPESTAN(به خاطر محدودیت سایت در درج بعضی کلمات ، این کلمه به صورت فینگیلیش درج شده ولی در فایل اصلی پایان نامه کلمه به صورت فارسی نوشته شده است)داران تولید شده است (۱۲،۱۱). بیان پروتئین L1 در E.coli باعث تولید ذرات شبه ویروسی کوچک می شود. این ذرات پنتامر ۱۲ تایی بوده و دارای ساختار ۲۰ وجهی هستند. این ذرات شبه ویروسی به خوبی سیستم ایمنی هومورال را تحریک میکنند و بعنوان واکسن پروفیلاکتیک استفاده میشوند (۱۳). پروتئین L2 در تجمع کپسید ویروس نقش دارد و در ضمن دارای اپی توپهای خنثی کننده نیز می باشد. احتمالا وجود پروتئین۲ L در واکسن میتواند از طیف گسترده تری از تیپ های ویروسی پیشگیری کند. هرچند که اپی توپ های خنثی کننده آن شبیه به L1 توانایی حفاظت کنندگی را ندارند اما اپی توپ های آن واکنشهای متقاطع را القا می کنند (۱۴،۱۵،۱۶ و ۱۷).

پروتئین های اولیه E1 و E2 برای تکثیر و باقیماندن ژنوم ویروس مورد نیاز می‌باشند. پاپیلوماویروس های انسانی، پروتئین E3 را ندارند. پروتئین E4 از ناحیه اولیه کد می شود اما در مراحل تاًخیری عفونت بیان شده، باعث گریز ویروس از سلولهای آلوده می گردد (۴،۲). E5 یک پروتئین انکوژن است که رسپتورهای اختصاصی فاکتور رشد را فعال می کند و در ترانسفورمیشن خوش خیم نقش دارد(۲). E6 وE7 انکوپروتئین های اصلی پاپیلوماویروس را کد می کنند. انکوپروتئین E6 مانند پروتئین E1B آدنو ویروس تیپ ۵ و آنتی ژن T بزرگ ویروس SV40 قادر است به پروتئین  سرکوب کننده تومور پروتئین های P53 و E6 باعث ممانعت از تعمیر DNA آسیب دیده یا ممانعت از القاء مرگ برنامه‌ریزی شده می گردد و در نهایت باعث تجمع جهش های ژنتیکی درسلول‌های آلوده شده و سلول ها  رشد بی رویه ای را آغاز      می کنند و سرانجام به صورت سرطانی در می آیند (۱۸).

بیش از ۲۰۰ تیپ پاپیلوما ویروس انسانی شناسایی شده است که تفاوت های ژنومی در توالی های DNA دارند (۱۹،۵) . پاپیلوماویروس های انسانی قادرند سلول های اپی تلیال بازال پوست و دیواره داخلی     بافت ها را آلوده کنند و بر این اساس به انواع پوستی و مخاطی طبقه بندی می شوند. انواع مخاطی         می توانند دیواره دهان، گلو ، دستگاه تنفس یا اپی تلیوم آنوژنیتال را آلوده نمایند و براساس ارتباط آنها با سرطان گردن رحم و جراحات پیش ساز ، به انواع پر خطر ، با خطرمتوسط و کم خطر تقسیم بندی      شده اند (۱، ۲۰ ،۲۱).

تعداد صفحه : ۲۱۲

قیمت : ۱۴۷۰۰تومان

بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد

و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.

پشتیبانی سایت :        *       [email protected]

در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.

 

[add_to_cart id=151870]

—-

پشتیبانی سایت :       

*